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利用宿主基因体检来进行预测干扰素疗效的基因检测
　

HBV感染者干扰素治疗效果好者多见HLA-DRB1* 14 allele而少见DQB1*07 allele。 eIF-2alpha gene的regulatory region的 A/G alleles干扰素治疗效果好者A/G heterozygotes少见，而MxA gene promoter 的-88 G/T alleles中干扰素治疗效果好者 G/T heterozygote多见。
有研究表明Interferon regulatory factor-1 (IRF-1) -300AA 的genotype 1的HCV感染者干扰素治疗效果好些。 HCV感染者中TGFbeta -10 genotype CC 者治疗反应相对佳，HCV genotype 1感染者G protein beta3 subunit (GNB3)genotyp CC及TC多治疗低反应，osteopontin （OPN） promoter SNP中-1748 G/G 或 G/A alleles 多治疗高反应，OPN promoter SNP中-443 T/T allele多治疗高反应，特别是治疗前高病毒血症的HCV genotype 1b 感染者，OPN promoter genotype -1748 G/G 或 G/A 和-443 T/T 的HCV感染者对IFN均持续性抗病毒性反应。MxA-T阳性与Interferon治疗反应有关，MxA[-88], MxA[-123], MBL[X/Y],MBL[A/B]与Interferon治疗反应有关，Cytotoxic T lymphocyte antigen-4 (CTLA4)promoter site -318 和 exon-1 site 49 中49G和49G318Chaplotype与interferon-alpha plus ribavirin 治疗的持续反应有关（sustained responders）, LMP7-K gene 在持续治疗反应中多见， Interferon (IFN)-inducible MxA protein -88 G/G homozygosity 与无治疗反应密关，MxA gene promoter-123 C/C homozygotes 与无治疗反应有关， MxA gene promoter 123A88T为高促进子活性（与持续治疗反应有关），IL-10 -592A, -819T或 extended haplotype (108bp) - (-2575T) - (-2763C) - (-1082A) - (-819T) - (-592A)与持续治疗反应有关。
应该说，干扰素治疗反应有赖于细胞内不同抗病毒性干扰素相关反应途径的综合效应，而非单凭某一基因所能决定，因此我们也不能单凭某一基因的SNP来预测整个生物体（宿主）对干扰素反应有无及反应持续与否。
利用宿主基因体检来进行预测干扰素疗效的基因检测，是利用宿主干扰素相关的抗病毒反应相关关键基因的SNP进行检测，来预测宿主机体的干扰素疗效，但鉴于IFN抗病毒反应的最终不同结果是与细胞内不同抗病毒性干扰素相关反应途径的综合效应，则HBV病毒等病毒不断变异也可能可致其对机体控制病毒不力即病毒基因中干扰素抗病毒因子元件结合位点变异而可能致耐干扰素的病毒变异株产生，如有研究表明HBV的转录后调节序列 (post-transcriptional regulatory element，HPRE）的1504nt与干扰素治疗的应答有关，其1504nt(T-C)变异可能与干扰素治疗的应答发生改变有关，因此宿主基因体检来进行预测干扰素疗效的基因检测只能预测其干扰素反应的机率(0-100%)，而非单纯的“YES/有效”和“NO/无效”，应结合HBV全基因组的测序明确定HBV上的对干扰素应答相关抗病毒因子元件结合位点变异情况，来确定其对干扰素的反应性。